エクスプローラー

プロジェクトや構造情報ファイルなどを表示・管理します。表示領域には、本ソフトウェアで扱える項目のみが表示されます。原子構造はアイコンが3D表示され、ドラッグ操作で回転させて確認できます。(プロジェクトの実体はフォルダー(ディレクトリ)ですが、構造情報ファイルと同様に表示されます。)

解析したい構造情報ファイルを開くと、解析を行うプロジェクト画面に移行できます。

../_images/explorer.svg

ロケーションバー

表示している場所のパス(コンピューター内の場所)を表示します。パスを入力し Enter キーを押すと、その場所に移動します。WindowsでCドライブ以外の場所を表示したい場合はこちらをご使用ください。

folder アイコンをクリックすると、表示しているフォルダーを外部ファイラーで開きます。

表示変更

表示領域のアイコンの大きさを選択します。 List を選択すると、各項目の詳細情報をリスト表示します。

対応する構造情報ファイル形式

.cif

Crystallographic Information Framework

.xyz

XYZ chemical file format

.xsf, .axsf

XCrySDen file format

POSCAR, CONTCAR

VASP input file

元素名の行が含まれている必要があります。

.in, .qe, .qein, .pw, .pwin, .pwi, input

Quantum ESPRESSO input file

nfinp.data

Advance/PHASE input file

.cube, .cub

Gaussian cube file

.lmp, .lammps

LAMMPS data file

read_dataで指定されたdataファイルから構造を読み込みます。

.lammpstrj, .dump

LAMMPS dump file

element列が出力されている必要があります。

.mol, .sdf

MDL Molfile

sannp.metro

Advance/NeuralMD メトロポリス法設定ファイル

以下の各方法でファイルを開くことができます。

  • エクスプローラーでファイルのあるフォルダに移動し、ファイルをダブルクリックする

  • NanoLaboの画面上にファイルをドラッグ&ドロップする

  • NanoLaboの起動アイコンにファイルをドラッグ&ドロップする

  • NanoLaboの実行ファイルに引数として渡し、実行する

項目の操作

表示領域のプロジェクトや構造情報ファイルは、右クリックメニューからコピー・リネーム等の操作ができます。

ショートカットキー一覧

操作

開く

Enter

全選択

Ctrl + A

全選択解除

Esc

削除

Ctrl + D

リネーム

F2

切り取り

Ctrl + X

コピー

Ctrl + C

貼り付け

Ctrl + V

インクリメンタル検索

検索文字列

* macOSでは CtrlcommandAltoption と読み替えてください。