入力ファイルエディター(LAMMPS固有の設定)

Force-Field(力場)

入力ファイルエディターの Force-Field で力場の設定を行います。画面右下のメニュー editormenuicon から Force-Field をクリックしてください。

Type of Force Field で使用したい力場の種類を選ぶと、それに対応した設定項目が有効になりますので、設定を行ってください。

力場の設定後、設定内容に応じて各原子のパラメーターを調整する必要がある場合には、 Resolve Force FieldApply ボタンが赤色になりますので、クリックして設定を反映させてください。

Lennard-Jones

Non-Bonded Interactions 欄でLennard-Jonesポテンシャル E=4\epsilon [(\sigma /r)^{12} -(\sigma /r)^6] のパラメーター\epsilon\sigmaを設定してください。

Charge & Lennard-Jones

Lennard-Jonesポテンシャルのパラメーターに加え、電荷を設定して下さい。全電荷が0でない場合、 Resolve Force FieldApply ボタンをクリックすると、全電荷が0になるように一定の値を差し引きます。

OPLS-AA

Resolve Force FieldApply ボタンをクリックすると、OPLS-AAパラメーターセットに基づき、電荷およびLennard-Jonesポテンシャルのパラメーターを設定します。その後、全電荷が0になるように一定の値を差し引きます。

Non-Bonded Interactions 欄の各行を右クリックすると、割り当ての詳細を確認できます。

../_images/opls.png

Scheme(計算過程)

入力ファイルエディターの Scheme で計算過程の設定を行います。画面右下のメニュー editormenuicon から Scheme をクリックしてください。

画面右側のパネルで計算の設定を行い、 Add SchemeApply をクリックすると、画面左側に設定内容がタイル状に表示されます。必要に応じ、設定 → Apply を繰り返して過程を追加していきます。

タイルの左上の数字が過程の実行される順番です。前へボタン lpback 、後へボタン lpfwd で順番を入れ替えます。削除ボタン lpdel で削除します。

追加済みのタイルの設定を後から編集するには、タイルをダブルクリックしてください。 Set the scheme ウィンドウが表示され、設定を編集できます。

../_images/scheme.png